Hola,
Las ciudades actualmente se pueden quedar en negativo pero, eso trae consecuencias como en el más extremo de la eliminación de la ciudad si alcanzas una deuda alta. Revisa bien que las tasas que tengáis sean las suficientes para mantener la ciudad.
De todas maneras, si ingresas y persiste el problema, vuelve a crear un post para que podamos revisar de nuevo.
Un saludo!